6 stycznia 2004 roku w centrali Agencji odbyło się spotkanie rozpoczynające audyt akredytacyjny Agencji Restrukturyzacji i Modernizacji Rolnictwa. Oprócz przedstawicieli ARiMR i Agencji Rynku Rolnego oraz audytora KPMG wzięli w nim także udział reprezentanci Ministerstwa Finansów i Ministerstwa Rolnictwa i Rozwoju Wsi.
Minister Finansów - zgodnie z ustawą z 30 lipca 2003 roku o uruchamianiu środków pochodzących z Sekcji Gwarancji Europejskiego Funduszu Orientacji i Gwarancji Rolnej - powierzył zadanie przeprowadzenia audytu akredytacyjnego ARiMR i ARR firmie KPMG, wyłonionej w drodze przetargu. Ministerstwo Finansów zawarło umowę z tą firmą 30 grudnia 2003 roku. Podczas spotkania ustalono ramy organizacyjne audytu akredytacyjnego. Audyt będzie prowadzony w trzech obszarach:
Zakończenie pierwszego etapu audytu planowane jest do dnia 16 marca 2004 r., zgodnie z podpisaną umową dalsze prace audytorskie potrwają do końca 2005 roku.