W unijnych systemach podatku dochodowego ujednolicone zostało pojęcie dochodu przedsiębiorstwa podlegającego opodatkowaniu. Dochody z działalności rolniczej podlegają tam takim samym zasadom opodatkowania jak dochody z działalności pozarolniczej.
W UE ujednolicono pojęcie dochodu przedsiębiorstwa podlegającego opodatkowaniu oraz ustalono za niedozwolone wprowadzanie przepisów podatkowych, które mogłyby ograniczyć swobodę przepływu kapitałów pomiędzy państwa mi członkowskimi. W poszczególnych państwach członkowskich obowiązują jednak krajowe systemy podatku dochodowego, w których ustala się stawki i zakres opodatkowania.
Generalnie w krajach Unii Europejskiej jednakowo opodatkowane są dochody niezależnie od źródeł ich powstawania. Oznacza to, że dochody z działalności rolniczej podlegają takim samym zasadom opodatkowania jak dochody z działalności pozarolniczej. Należy jednak dodać, że podatek dochodowy płacony przez unijnych rolników jest podatkiem niezależnym od podatku majątkowego płaconego od rynkowej wartości ziemi rolniczej i budynków. Wyjątkiem jest Wielka Brytania, na terenie której nie nalicza się podatku od wartości ziemi i budynków.
Państwa członkowskie indywidualnie ustalają podstawę do opodatkowania dochodów z działalności rolniczej przyjmując do tego celu:
Podstawę dochodu do opodatkowania ustala się w drodze szacunku lub według rzeczywistych danych wynikających z prowadzenia ksiąg rachunkowych. Na przykład rolnicy we Francji, w zależności od uzyskiwanych przychodów w ostatnich dwóch latach podatkowych poprzedzających dany rok podatkowy, płacą podatek dochodowy od dochodów określonych na podstawie:
Stawki podatku dochodowego są progresywne, zróżnicowane w poszczególnych krajach UE i wynoszą od 27 do 72%.
Unijni rolnicy korzystają z różnego rodzaju ulg i zwolnień podatkowych, do których zalicza się możliwość odliczania od dochodu wydatków inwestycyjnych – czyli tzw. przyspieszoną amortyzację.