W ministerialnych wyjaśnieniach podkreślono, że ustawa o opłacie skarbowej nie zawiera generalnego wyłączenia czy zwolnienia od opłaty skarbowej dla podań ani wydawanych na ich skutek zaświadczeń, niezbędnych rolnikom zwracającym się do Agencji Restrukturyzacji i Modernizacji Rolnictwa oraz Agencji Rynku Rolnego o pomoc finansową z programów Unii Europejskiej.
Według ministerstwa, w sprawach zaświadczeń niezbędnych rolnikom do uzasadnienia wniosków składanych do agencji mogą mieć zastosowanie dwa wyłączenia: dotyczące osób ubogich (z art. 2 ust. 1 pkt 6 ustawy o opłacie skarbowej), a także zwolnienie zaświadczeń o wielkości użytków rolnych gospodarstwa rolnego (określone w ust. 11 kol. 4 pkt 5 część III załącznika ustawy).
Ponadto w piśmie zwrócono uwagę, że rolnik będzie musiał uiścić opłatę skarbową, jeżeli wydane zaświadczenie potwierdza również inne fakty, np. okres prowadzenia gospodarstwa rolnego. W zależności od treści wydanego zaświadczenia, opłata wyniesie 11 zł od zaświadczenia potwierdzającego okres prowadzenia gospodarstwa rolnego i 15 zł od zaświadczenia w sprawie zaległości w zobowiązaniach podatkowych. I to nawet jeżeli zaświadczenia wydawane są w jednym dokumencie.
(Pismo Ministerstwa Finansów LK-835/78/JB/05/459 z 8 lipca 2005 r.).