30 kwietnia 2010 roku Agencja wpłaciła do Funduszu Rekompensacyjnego, w ramach zobowiązań nałożonych przez ustawę o realizacji prawa do rekompensaty z tytułu pozostawienia nieruchomości poza obecnymi granicami Rzeczypospolitej Polskiej, kwotę 50 mln zł, stanowiącą zaliczkę za I kwartał 2010 roku.
Łącznie Agencja wpłaciła już na ten cel ponad 2,2 mld zł.