Przestrzeganie wymogów Wzajemnej Zgodności powiązane jest z wysokością uzyskiwanych płatności bezpośrednich. Wymogi te podzielono na trzy obszary:
Obszar A, który obejmuje:
*Identyfikację i rejestrację zwierząt,
*Zagadnienia ochrony środowiska naturalnego
Obszar B, obejmujący:
*Zdrowie publiczne,
*Zdrowie zwierząt, zgłaszanie niektórych chorób,
*Zdrowotność roślin
Obszar C, w którym zawiera się:
*Dobrostan zwierząt
Rok 2007 był pierwszym rokiem, w którym rolników z państw UE-15 kontrolowano pod kątem wypełniania wszystkich wymogów Wzajemnej Zgodności. W nowych państwach członkowskich wymogi te będą obowiązywać stopniowo. Od 1 stycznia 2009r. obowiązywać będzie obszar A:
ZAGADNIENIA OCHRONY ŚRODOWISKA NATURALNEGO:
Wymóg 1: Ochrona dzikiego ptactwa
Wymóg 2: Ochrona wód podziemnych przed skażeniem substancjami niebezpiecznymi
Wymóg 3: Zasady stosowania osadów ściekowych w rolnictwie
Wymóg 4: Ochrona wód przed azotanami pochodzenia rolniczego
Wymóg 5: Ochrona dzikiej fauny i flory
IDENTYFIKACJA I REJESTRACJA ZWIERZĄT (6-8a)
Zgodnie z aktualnym stanem prawnym, obszary B i C wdrażane będą od 2011 roku. Polska w ramach Przeglądu WPR Health Check wnioskuje, aby obszar C wdrożyć od 2013 r.
Obszar B:
Zdrowie publiczne, zdrowie zwierząt, zgłaszanie niektórych chorób oraz zdrowotność roślin:
Wymóg 9: Zdrowotność roślin
Wymóg 10: Zakaz stosowania związków o działaniu hormonalnym, tyreostatycznym i beta-agonistycznym
Wymóg 11: Bezpieczeństwo żywności i pasz
Wymóg 12: Zapobieganie, kontrola i zwalczanie niektórych przenośnych encefalopatii
Wymóg 13 - 15: Zgłaszanie chorób zakaźnych zwierząt
Obszar C:
Dobrostan zwierząt:
wymóg 16-18: minimalne normy ochrony cieląt, minimalne normy ochrony świń, ochrona zwierząt gospodarskich